Rynnowe Jeziora Zbąszyńskie stanowią przeważającą część szlaku wodnego Obry. Pierwsze kilometry wiodą rzeką, następnie przebiega przez płytkie i zarastające jezioro Zacisze. Sąsiadujące z nim jezioro Kopanickie, które jednak odgrodzone jest od głównego nurtu drewnianą zaporą. Kolejnym jeziorem jest jezioro Wielkowiejskie. Na jego południowym brzegu rozłożyła się wieś Wąchabno. Z tym zbiornikiem wodnym łączy się bezpośrednio jedno z najpiękniejszych jezior szlaku – jezioro Chobienickie (125 ha) – posiadające dwie wyspy, z których jedna nosi nazwę Wyspy Owczej. Na uwagę zasługuje także jeden z półwyspów zwany wyspą Konwaliową, na którym znajduje się rezerwat czapli siwej. Do następnych jezior ; Grójeckiego i Nowowiejskiego płynie się rzeką. Za jeziorem Nowowiejskim znajduje się jedno z największych w Wielkopolsce jezioro Błędno (Zbąszyńskie) o powierzchni ponad 750 ha. Chcąc wypłynąć z tego jeziora na Obrę, należy kierować się na wieże kościelne. Dalej wpływa się w niewielkie, głębokie rozszerzenie koryta rzeki, zwane Kotłem Czarownic, za którym znajduje się mostek a potem tama, przez którą należy przenieść kajaki.

Płynąc dalej Obrą mija się leżącą na wschodni brzegu wieś Przyprostynię. Za Zbąszyniem Obra opływa Strzyżewską Górę z widoczną z dala cegielnią. Dalej rzeka płynie wśród łąk, a później lasem. Kolejnym jeziorem jest jezioro Lutolskie, które posiada dwie wyspy oraz liczne, porośnięte borem półwyspy. Dalej wpływa się do jeziora Młyńskiego, nad którym leży miasto trzciel. Za Trzecielem Obra płynie wśród wierzbowych zarośli, wpada do jeziora Wielkiego, początkowo mocno zarośniętego grążelem żółtym. Jezioro posiada lesiste wyspy oraz półwyspy, łączy się z nim jezioro Konin oraz ostatnie z grupy jezior zbąszyńskiech – Rybojadło, nad którym leży wieś Rybojady. Tuż za wyjściem z jeziora znajduje się most i kolejna zapora.